自动抛光机操作的关键是寻求更高的抛光速率，以便尽快去除抛光过程中产生的损伤层。同时，磨料损伤层不应影响观察到的组织。也是说，它不应该导致虚假组织。前者需要使用较粗的磨料来保证较高的抛光速度以去除磨料损伤层，但也会加深磨料损伤层。后者需要使用更精细的材料，使抛光损伤层更浅，但抛光速率较低。自动抛光机解决这一矛盾的方法是将研磨分为两个阶段。以下是操作自动抛光机的一些技巧。
自动抛光机使用方法比较简单，整个抛光过程都是自动化。操作人员可将需要抛光的材料放到夹具上，之后将其固定到抛光机的工作台上，然后就可以启动抛光机了，在完成抛光之后机器会自动停止，这时只需要将材料卸下来即可。这里需要注意的是在进行抛光之前，需要调整抛光头与工作台的距离，以提高抛光的效果。在抛光的过程中可以用手工，这样可以降低抛光的成本
为了保障抛光的效果，要掌握抛光的方向，如果过度倾斜或者是没有摆放好的话会很容易导致全自动抛光机故障和产品出现问题的
如果以前使用时没觉得这么烫手，而现在用一会儿便很烫手，先要确定机器是否超载运行，比如：用小型自动抛光机抛光比较长的钢管，并且支架没有安装导轮，这样在抛光时，钢管的输送阻力会很大，增加电机的运转负荷，用的时间不长便会觉得电机非常烫手
